Para conocer la situación  de los sistemas productivos, resulta pertinente analizar la relación entre agroecología y problemáticas que afectan actualmente a los sistemas productivos y alimentarios del país, entre ellas la degradación de los recursos naturales, pérdida de biodiversidad agrícola, dependencia de insumos externos, variabilidad y cambio climático, inseguridad alimentaria, dificultades de acceso a mercados, condiciones de acceso a tierra y agua y las limitaciones de financiamiento y asistencia técnica. En este contexto, y en el marco del proyecto regional, se plantea la realización de un estudio nacional sobre los avances de la agroecología en Honduras. Dicho estudio formará parte de un proceso regional que contempla investigaciones similares en cuatro países de Centroamérica.